ДНК-хеликазы, геномная нестабильность и наследственные болезни человека

DNA Helicases, Genomic Instability, and Human Genetic Disease
Anja J.van Brabant, Rodica Stan, and Nathan A.Ellis
Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2000. 1: 409-59
e-mail: n-ellis@ski.mskcc.org

ДНК-хеликазы – это филогенетически устойчивая группа ферментов, способных разделять цепи молекулы ДНК, переводя ее из нативного состояния в одноцепочечное. ДНК-хеликазы участвуют во всех процессах, происходящих с разделением родительских цепей ДНК – репликации, репарации, рекомбинации и транскрипции [39]. Хеликазы обеспечивают доступность открываемых ими одноцепочечных участков ДНК для действия других ферментов. По сродству к субстрату хеликазы подразделяются на группы: ДНК-хеликазы, РНК-хеликазы и хеликазы, работающие на гибридных молекулах ДНК/РНК. ДНК-хеликазы участвуют в репарации, рекомбинации, сегрегации хромосом и инициации транскрипции. К функции РНК-хеликаз относят участие в биогенезе рибосом, транскрипции мРНК, сплайсинге пре-мРНК, созревании и транспорте РНК в цитоплазму, а также в трансляции [32]. Генетика РНК-хеликаз еще недостаточно изучена, поэтому в обзоре авторы сосредоточили свое внимание на ДНК-хеликазах микроорганизмов и млекопитающих, в том числе человека.

 Хеликазы являются энергозависимыми ферментами. Они используют энергию, образующуюся при гидролизе нуклеотид 5’-трифосфатов, обычно АТФ, и действуют в присутствии ионов Mg²⁺. Хеликазы идентифицируют по двум характеристикам: а) наличию хеликазной активности, т.е. способности двигаться вдоль молекулы ДНК, разделяя ее на отдельные цепи; б) наличию семи мотивов аминокислотной последовательности, присущих семейству хеликаз [63]. Первая характеристика свойственна всем хеликазам, вторая не является обязательной. Семь аминокислотных мотивов, обозначаются как I, Ia, II, III, IV, V и VI. Мотивы I и II обнаруживаются у многих белков, которые подобно хеликазам используют нуклеотидтрифосфаты в качестве кофактора.  Мутации в этих мотивах приводят к дефициту АТФ-зависимой активности. Остальные мотивы являются специфичными для хеликаз и обеспечивают их взаимодействие с молекулой ДНК и координацию движения во время катализа. Мутации в них могут влиять на перемещающую по цепи активность хеликазы, но не снижают АТФ-связывающей способности [68a, 68b]. Хеликазы отличаются друг от друга предпочтительным сродством с 3’и 5’ концами цепи, 3’-5’и 5’-3’ направлением хеликазной активности, нуклеотидтрифосфатами, используемыми в качестве кофактора и другими свойствами. Для проведения какого-либо процесса хеликазы, как правило, объединяются в комплексы. Наряду с этим идентифицированы белки, имеющие семь хеликазных мотивов, но не обладающих хеликазной активностью [38]. Они получили название белки-претенденты в хеликазы  [40]. Считают, что эти белки также должны участвовать в регуляции транскрипции, репарации и рекомбинации [162].

При изучении пространственной организации хеликаз ученые пришли к выводу, что они имеют кристаллическую структуру, образующуюся за счет того, что белковые домены располагаются по отношению друг к другу под определенным углом [3, 9, 17, 87, 92, 107, 170, 186]. Этот угол может меняться при взаимодействии хеликазы с субстратом, кофактором и белками [204]. Изменение пространственного положения доменов обеспечивает движение хеликазы вдоль цепи ДНК. Предполагают существование двух механизмов перемещения хеликаз по нуклеотидной цепи [186, 205, 210]. Эти механизмы получили название активно катящейся модели и постепенно скользящей модели. Разделение ДНК по активно катящейся модели осуществляется димером хеликазы, который за один цикл (поворот) разъединяет определенное число нуклеотидных пар. В осуществлении схемы постепенно скользящей модели участвует мономер, движущийся с определенной  скоростью.

Количество генов, кодирующих хеликазы в геноме человека точно не известно, но некоторые из них уже хорошо изучены. В обзоре наиболее подробно рассмотрены хеликазы, входящие в TFIIH и хеликазы семейства RecQ.

TFIIH – это основной транскрипционный фактор, состоящий из девяти субъединиц: хеликаз XPB и XPD, белков p62, p52, p44, p34, и трех субъединиц САК – МАТ1, циклина Н и Cdk7 [181]. TFIIH обладает АТФ-зависимой, хеликазной и киназной активностью. АТФ-зависимая и хеликазная активности обеспечиваются субъединицами XPB и XPD, киназная – комплексом САК (CDK-activating-kinase). TFIIH участвует в вырезании нуклеотидов при репарации ДНК (nucleotide excision repair (NER)), и транскрипции  [37, 50, 148]. Как фактор репарации TFIIH разделяет участок ДНК длиной 20-30 н.п., содержащий повреждение. Как основной транскрипционный фактор TFIIH взаимодействует с промоторной областью, раскручивая участок ДНК, длиной 11-13 н.п. вокруг сайта инициации транскрипции [36].

NER сохранил филогенетическую консервативность от E.сoli до человека и лежит в основе поддержания стабильности генома [4, 31, 69, 75, 120, 138, 151, 161, 185]. Этот процесс базируется на распознавании и устранении клеточными ферментами специфических повреждений ДНК, вызванных неблагоприятными факторами среды. Примером болезни человека, связанной с недостаточностью NER является рак кожи, которая улавливает большую часть УФ лучей. NER состоит из четырех шагов: распознавание поврежденного участка ДНК; разделение цепей поврежденого участка ДНК; удаление цепи ДНК, содержащей изменение нуклеотидной последовательности; синтез удаленного фрагмента и его лигирование в материнскую цепь ДНК. В клетках существуют две системы NER: а) процесс общей геномной репарации (general genomic repair (GGR)) и процесс репарации транскрибируемых генов (transcription-coupled repair (TCR)). При NER по варианту GGR поврежденный участок ДНК распознается комплексом XPC-hHR23B, который локально плавит место повреждения ДНК, делая его доступным для других ферментов репарации [112, 122, 171]. Для осуществления варианта TCR комплекс XPC-hHR23B не нужен, его функцию выполняет РНК Pol II, которая взаимодействует с факторами CSA и CSB [122]. Далее схемы GGR и ТCR имеют сходство. Участок ДНК, содержащий повреждение разделяется хеликазами XPB и XPD. Образующиеся одноцепочечные участки ДНК стабилизируются хеликазой ХРА и репликационным белком А (RPA) [74]. ХРА связывается с поврежденной цепью ДНК, а RPA – с неповрежденной. RPA является гетеротримером и связывается с ДНК в определенной ориентации [30], которая способствует присоединению хеликазы XPG к 5’концу, а комплекса ERCC1-XPF к 3’концу неповрежденной ДНК. Эти факторы проявляют свою эндонуклеазную активность и удаляют измененную аминокислотную цепь длиной 24-32 нуклеотида. XPG делает 3’разрезание, а комплекс ERCC1-XPF – 5’разрезание [121]. Образовавшаяся брешь заполняется общими репликационными факторами (PCNA, RFC, RPA и др.), которые осуществляют синтез олигонуклеотида. Фосфодиэфирные связи восстанавливаются лигазой.

Гены NER человека клонированы, они имеют сходство с аналогичными генами E.coli, дрожжей и дрозофилы. Дефекты NER у человека могут приводить к таким болезням как пигментная ксеродерма (xeroderma pigmentosum (XP)), которая характеризуется изменениями кожи в области воздействия УФ лучей и высоким риском развития опухолей кожи. Описано семь комплиментарных групп ХР, каждая из которых соответствует повреждению определенного гена [31]. Соответствующие гены названы XPA-XPG. Они кодируют хеликазы XPA-XPG, участвующие в NER. Среди них хорошо изученными являются хеликазы ХРВ и XPD. ХРВ является белком  длиной 782 аминокислоты с 3’-5’ активностью, XPD – белком длиной 760 аминокислот и 5’-3’ активностью [108, 147, 148, 174].

Кроме того, как признак пигментная ксеродерма обнаружена при других наследственных синдромах: синдроме Коккейна (Cockayne syndrome (CS)); трихотиодистрофии (Trichothiodystrophy (TTD)) [19]. При CS выделено пять комплиментарных групп, три их которых ассоциированы с ХР, и мутациями в генах ХРВ и ХРD [22, 184, 187]. Мутации в тех же генах обнаружены у больных TTD. Примечательно, что у больных CS и TTD нет наклонности к развитию рака кожи [166]. Генетические факторы комплиментарных групп CS не ассоциированных с ХР обозначены CSA и CSB.

У человека мутации в ХРВ встречаются редко, всего описано пять больных трое из которых имели признаки XP/CS, а двое – TTD [179, 200,201]. Фибробласты больных  XP/CS содержали мутацию Т296С и имели выраженное снижение репарации по сравнению с фибробластами больных TTD, имеющими мутацию А355С [139]. В экспериментах на трансгенных мышах показана разная чувствительность этих аллелей к типу повреждающего агента, а также кодоминантный эффект у кампаундных мышей.

Мутации в XPD встречаются чаще и наблюдаются у больных XP, XP/CS и TTD [19, 179]. Мутации, приводящие к ХР, в основном, сосредоточены в одном из мотивов XPD и повреждают процесс NER. Мутации, обнаруженные у больных XP/CS и TTD, снижают NER и транскрипционную активность TFIIH [98, 166].

Изучение сохранности функций TFIIH в клеточных линиях больных XP, XP/CS, TDD, имеющих разные мутации в XPB и XPD, позволило уточнить функции этих белков [20]. Мутации в XPD снижают ДНК-разделяющую и киназную активности комплекса [179]. Это свидетельствует о посреднической роли XPD в сцеплении в САК [36]. Мутации в ХРВ проявлялись снижением транскрипционной активности TFIIH, обусловленной потерей его способности открывать промоторную область [201]. Мутации в XPD и XPB в равной степени препятствуют NER за счет потери ДНК-разделяющей активности [46]. Кроме того, существует предположение, что TFIIH участвует в р53-опосредованном апоптозе. С-концевой домен р53 ингибирует хеликазную активность TFIIH путем связывания его XPD [141, 194, 195].

Для изучения роли хеликаз создаются и изучаются линии мышей, несущих мутации в генах, кодирующих эти ферменты. Показано, что нулевой аллель XPD приводит к гибели эмбриона мыши на стадии 2-х клеточного развития. Полное разрушение XPB также ассоциируется с ранней гибелью. Линия мышей с миссенс-мутацией в XPD (R722W), по своему фенотипу схожа с TTD человека [27]. Показано, что воздействие УФ лучей на клетки этих мышей снижает репарационный синтез ДНК и транскрипцию гена SPRR2, необходимого для дифференцировки кератиноцитов кожи. У мышей с мутацией в ХРА повышена склонность к развитию рака кожи [35].

Хеликазы RecQ объединены в семейство по сходству структуры и функции [93, 103,125]. Все члены семейства имеют центральный домен протяженностью 350 аминокислот, который содержит семь хеликазных мотивов. Некоторые RecQ хеликазы имеют гомологию С-концевой области. Специфичность хеликаз семейства RecQ, очевидно, определяется структурой N-конца. Функцией хеликаз семейства  RecQ является устранение структурных изменений, обнаруживающихся при репликации [15, 73]. В клетках различных организмов идентифицировано 22 хеликазы RecQ, из них пять хеликаз обнаружено в геноме человека – BLM, WRN, RECQ1, RECQ4 и RECQ5.

Изучение гена RecQ хеликазы дрожжей показало, что его мутации ассоциируются со значительным увеличением частоты рекомбинации, дефектами митотической и мейотической сегрегации хромосом [198, 199]. Применение непрямой иммунофлюоресценции с антителами BLM человека на препарированных сперматоцитах мыши, показало, что BLM влияет на взаиморасположение гомологичных хромосом при подготовке к расхождению в анафазе I мейоза. BLM нокаутированные эмбрионы мыши погибали на 13,5 день post coitum. У человека мутации в генах, кодирующих хеликазы семейства RecQ, приводят к развитию болезней, характеризующихся геномной нестабильностью. Среди них хорошо изучены генетические основы синдрома Блюма (Bloom syndrome (BS)) [61], синдрома Вернера (Werner syndrome (WS)) и синдрома Ротмунда-Томсона (Rothmund-Thomson syndrome (RTS)).

Клетки больных с BS содержат чрезмерное количество мутаций  в кодирующих и не кодирующих последовательностях ДНК. Хромосомы культуры лимфоцитов имеют повышенное количество хромосомных поломок, среди которых особенно часто встречаются квадрирадиальные, асимметричные четырехплечевые фигуры. В метафазах культуры клеток отмечено повышенное количество сестринских хроматидных обменов (СХО). Молекулярный анализ гаплотипа клеток с низким и высоким уровнем СХО у больных с BS привел к картированию гена BLM в 15q26.1 [42, 43]. Показано, что белок BLM формирует кольцевые гексаметрические структуры с отверстием диаметром 3,5 нм [85]. Предполагают, что через это отверстие должна проходить одна из цепей ДНК. Нозерн- гибридизацией обнаружено присутствие мРНК BLM во всех осмотренных тканях. Высокий уровень экспрессии гена зафиксирован в тимусе и яичках. Пиковый уровень экспрессии приходится на S-фазу клеточного цикла [62, 90]. При исследовании распределения и уровня экспрессии BLM в различных стимулированных к пролиферации и ингибированных линиях клеток получено несколько доказательств, подтверждающих, что BLM является регулятором клеточного деления. Кроме того, взаимодействие BLM с топоизомеразой выступает регулирующим моментом рекомбинации ДНК. Чрезмерность рекомбинационных событий может быть объяснена низкой топоизомеразной активностью при мутациях в BLM [205a].

У человека описано большое количество мутаций BLM, представляющих собой миссенс-мутации, олигонуклеотидные инсерции и делеции, приводящие к потере ферментной активности белка [43, 52, 61]. Поскольку, наиболее часто BS встречается среди евреев-ашкенази, в их популяциях выделена однотипная мутация, обозначенная как blm^Ash [41, 60, 128, 140, 158].  Эта мутация представляет собой делецию/инсерцию в позиции 2207 (нумерация от инициирующего кодона). Такая же мутация обнаружена у евреев-сафардов Испании.

Синдром Вернера – это редкое заболевание с аутосомно-рецессивным типом наследования, характеризующееся признаками преждевременного старения [45]. Кроме того, больные с WS предрасположены к развитию диабета и рака, особенно мягко-тканевой саркомы, тиреоидной карциномы и меланомы [145]. При исследовании культуры клеток больных WS обнаружен разнообразный транслокационный мозаицизм и снижение продолжительности жизни клеток [57a, 57b, 94]. Ген WRN локализован в интервале 8р12 [66]. WRN кодирует белок длиной 1432 аминокислоты. Мутации WRN, ассоциированные с WS,  включают преждевременные стоп-кодоны, сдвиги рамки считывания, олигонуклеотидные вставки и делеции экзонов [119]. Миссенс-мутации встречаются не часто. Нозерн-гибридизация выявила экспрессию WRN во всех тканях, высокий уровень экспрессии обнаружен в клетках  поджелудочной железы и яичках [212]. Иммунофлюоресцентный анализ нормальных фибробластов показал, что WRN локализуется в ядре клеток [68,  111]. В экстрактах из клеток больных с WS обнаружены дефекты репарации неправильно спаренной ДНК. Медленная прогрессия репликационной вилки в клетках больных с WS подтверждает участие WRN в репликации. WRN способен разделять молекулу ДНК только в присутствии репликационного белка - RPA. Есть гипотеза, что преждевременному старению способствует нарушение взаимодействия между WRN и транскрипционным белком p53. На основе изучения хеликазы RecQ дрожжей сделано предположение что, старение их  клеток может быть обусловлено нестабильностью рибосомальной ДНК [164]. Однако эти выводы не могут быть перенесены на клетки млекопитающих.

Нокаутированные WRN мыши выживают, но количество выживших мышей значительно меньше ожидаемого по менделевскому распределению. Это подтверждает снижение жизнеспособности гомозигот. Фибробласты этих мышей отличаются преждевременной потерей способности пролиферировать, а стволовые клетки – повышенной чувствительностью к ингибиторам топоизомеразы.

Синдром Ротмунда-Томсена известен также как врожденная пойкилодермия  [188, 189]. Цитогенетический анализ клеток больных с RTS выявляет нестабильность генома, проявляющуюся различными хромосомными перестройками, включая изохромосомы 2р и 8q, трисомии 8 [33, 102, 211]. Считают, что причиной RTS являются мутации в гене RECQL4, локализованном в 8q24.3 [90]. RECQ4 кодирует белок длиной 1208 аминокислот [89]. Филогенетический анализ подтвердил раннюю дивергенцию RECQ4 от своего семейства [90]. Наиболее высокая экспрессия этого гена обнаружена в тимусе и яичках. Характер экспрессии мРНК аналогичен BLM, экспрессия увеличивается на границе G1/S фаз. Мутации в гене RECQ4 обнаружены лишь у половины больных с RTS [91]. Все идентифицированные мутации приводят к преждевременной терминации трансляции и обнаружены у больных в компаундном состоянии. У второй половины больных с RTS мутации отсутствуют как в RECQ4, так и в генах BLM и WRN. Предполагают, что RTS является генетически гетерогенной болезнью, и не все генетические причины известны.

Белок RECQ1 имеет протяженность 659 аминокислот и локализуется в ядре клеток [137, 153, 154]. Ген RECQ1 экспрессируется во всех типах клеток, повышенный уровень наблюдается в поджелудочной железе и яичках. Подобно WRN, RECQ1 действует на границе G2/M фаз [90]. Ассоциативной связи между какой-либо болезнью человека и мутациями в RECQ1 не обнаружено. Не существует также клеточных линий с недостаточностью RECQ1. Его функции исследуются.

RECQ5 – это небольшой белок, длиной 410 аминокислот имеющий типичную структуру хеликазы [90]. Экспрессия его мРНК выявлена во всех тканях с высоким уровнем в поджелудочной железе и яичках. RECQ5 экспрессируется в эквивалентном количестве на протяжении всех фаз клеточного цикла. Белок RECQ5, по-видимому, имеет две изоформы за счет альтернативного сплайсинга [150]. Функция белка, его мутации и ассоциация его с каким-либо заболеванием еще не изучены.

Ожидается, что молекулярные механизмы действия хеликаз будут детально изучены в следующие пять лет.

LITERATURE  CITED

1. Aboussekhra A, Biggerstaff M, Shivji MKK, Vilp JA, Moncollin V, et al. 1995. Mammalian DNA nucleotide excision re­pair reconstituted with purified protein components. Cell 80:859-68

2. Abrahams JP, Leslie AGW, Lutter R, Walker JE. 1994. Stmcture at 2.8 A reso­lution of Fi-ATPase from bovine heart mitochondria. Nature 370:621-28

3. Allison TJ, Wood TC, Briercheck DM, Rastinejad F, Richardson JP, et al. 1998. Crystal stmcture of the RNA-binding do­main from transcription termination factor rho. Nat. Struct. Biol. 5:352-56

4. Araujo SJ, Wood RD. 1999. Protein com­plexes in nucleotide excision repair. Mutat.Res. 435:23-33

5. Bahr A, De Graeve F, Kedinger C, Chatton B. 1998. Point mutations causing Bloom's syndrome abolish ATPase and DNA hell-case activity of the BLM protein. Oncogene 17:2565-71

6. Balajee AS, Machwe A, May A, Gray MD, Oshima J, et al. 1999. The Wemer syn­drome protein is involved in RNA polymerase II transcription. Mol. Biol. Cell 10:2655-68

7. Bennett RJ, Sharp JA, Wang JC. 1998. Purification and characterization of the Sgsl DNA helicase activity of Saccharomyces cerevisiae. J. Biol. Chem. 273:

9644-50

8. Bennett SE, Umar A, Oshima J, Monnat RJ Jr, Kunkel TA. 1997. Mismatch repair in extracts of Wemer syndrome cell lines. Cancer Res. 57:2956-60

9. Benz J, Trachsel H, Baumann U. 1999. Crystal stmcture of the ATPase domain of translation initiation factor 4A from Saccharomyces cerevisiae—the prototype of the DEAD box protein family. Struct. Fold. Des. 7:671-79 10. Beresten SF, Stan R, van Brabant AJ, Ye T, Naureckiene S, Ellis NA. 1999. Purifica­tion ofoverexpressed hexahistidine-tagged BLM N431 as oligomeric complexes Pro­tein Expr. Purif. 17:239-48

11. Bessho T, Sancar A, Thompson LH, The-len MP. 1997. Reconstitution of human excision nuclease with recombinant XPF-ERCC1 complex. J. Biol. Chem. 272:3833-37

12. Blander G, Kipnis J, Leal JF, Yu CE, Schel-lenberg GD, Oren M. 1999. Physical and functional interaction between p53 and the Wemer's syndrome protein. J. Biol. Chem. 274:29463-69

13. Boddy MN, Howe K, Etkin LD, Solomon E, Freemont PS. 1996. PIC 1, a novel ubiquitin-like protein which interacts with the PML component ofamultiprotein com­plex that is disrupted in acute promyelo-cytic leukaemia. Oncogene 13:971-82

14. Brosh RM Jr, Orren DK, Nehlin JO, Ravn PH, Kenny MK, et al. 1999. Functional and physical interaction between WRN heli­case and human replication protein A. J. Biol. Chem. 274:18341-50

15. Chakraverty RK, Hickson ID. 1999. De­fending genome integrity during DNA replication: a proposed role for RecQ fam­ily helicases. BioEssays 21:286-94

16. Chester N, Kuo F, Kozak C, O'Hara CD, Leder P. 1998.  Stage-specific apopto-sis, developmental delay, and embryonic lethality in mice homozygous for a tar­geted disruption in the murine Bloom's syndrome gene. Genes Dev. 12:3382-93

17. Cho HS, Ha NC, Kang LW, Chung KM, Back SH, et al. 1998. Crystal stmcture of RNA helicase from genotype Ib hep­atitis C vims: a feasible mechanism of un­winding duplex RNA. J. Biol. Chem. 273: 15045-52

18. Chu G, Chang E. 1988. Xeroderma pig-mentosum group E cells lack a nuclear factor that binds to damaged DNA. Science 242:564-67

19. Cleaver JE, Thompson LH, Richardson AS, States JC. 1999.  A summary of mutations in the UV-sensitive disorders: xeroderma pigmentosum, Cockayne syn­drome, and trichothiodystrophy. Hum. Mu-tat. 14:9-22

20. Coin F, Bergmann E, Tremeau-Bravard A, Egly JM. 1999. Mutations in XPB and XPD helicases found in xeroderma pig­mentosum patients impair the transcription function ofTFIIH. EMBO J. 18:1357-66

21. Coin F, Marinoni JC, Rodolfo C, Fribourg S, Pedrini AM, Egly JM. 1998. Muta­tions in the XPD helicase gene result in XP and TTD phenotypes, preventing inter­action between XPD and the p44 subunit ofTFIIH.Ato Genet. 20:184-87

22. Cooper PK, Nouspikel T, Clarkson SG, Leadon SA. 1997. Defective transcription-coupled repair of oxidative base damage in Cockayne syndrome patients from XP group G. Science 275:990-93

23. Courcelle J,  Carswell-Crumpton C, Hanawalt PC. 1997. recF and recR are re­quired for the resumption of replication at DNA replication forks in Escherichia coli. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94:3714-19

24. Courcelle J, Crowley DJ, Hanawalt PC. 1999. Recovery of DNA replication in UV-irradiated Escherichia coli requires both excision repair and recF protein function. J.Bacteriol. 181:916-22

25. Courcelle J, Hanawalt PC. 1999. RecQ and RecJ process blocked replication forks prior to the resumption of replication in UV-irradiated Escherichia coli. Mol. Gen. Genet. 262:543-51

26. Davey S, Han CS, Ramer SA, Klassen JC, Jacobson A, et al. 1998. Fission yeast radl2+ regulates cell cycle checkpoint control and is homologous to the Bloom's syndrome disease gene. Mol. Cell. Biol. 18:2721-28

27. de Boer J, de Wit J, van Steeg H, Berg RJ, Morreau H. 1998. A mouse model for the basal transcription/DNA repair syndrome triochothiodystrophy. Mol. Cell 1:981-90

28. de Boer J, Donker I, de Wit J, Hoeijmak-ers JH, Weeda G. 1998. Dismption of the mouse xeroderma pigmentosum group D DNA repanTbasal transcription gene re­sults in preimplantation lethality. Cancer Res. 58:89-94

29. de Boer J, van Steeg H, Berg RJ, Garssen J, de Wit J, et al. 1999. Mouse model for the DNA repair/basal transcription disor­der trichothiodystrophy reveals cancer pre­disposition. Cancer Res. 59:3489-94

30. de Laat WL, Appeldoom E, Sugasawa K, Weterings E, Jaspers NG, Hoeijmakers JH.

1998. DNA-binding polarity of human replication protein A positions nucleases in nucleotide excision repair. Genes Dev. 12:2598-609

31. de Laat WL, Jaspers NG, Hoeijmakers JH. 1999. Molecular mechanism of nucleotide excision repair. Genes Dev. 13:768-85

32. de la Cruz J, Kressler D, Linder P. 1999. Unwinding RNA in Saccharomyces cere-visiae: DEAD-box proteins and related families. Trends Biochem. Sci. 24:192-98

33. Der Kaloustian VM, McGill JJ, Vekemans M, Kopelman HR. 1990. Clonal lines of aneuploid cells in Rothmund-Thomson syndrome. Am. J. Med. Genet. 37:336-39

34. Desterro JM, Rodriguez MS, Hay RT. 1998. SUMO-1 modification of Ikap-paBalpha inhibits NF-kappaB activation. Mol. Cell 2:233-39

35. de Vries A, van Oostrom CTM, Hofhuis FMA, Dortant PM, Berg RJW, et al. 1995. Increased susceptibility to ultraviolet-B and carcinogens of mice lacking the DNA excision repair gene XPA. Nature 377: 169-73

36. Drapkin R, Le Roy G, Cho H, Akoulitchev S, Reinberg D. 1996.  Human cyclin-dependent kinase-activating kinase exists in three distinct complexes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:6488-93

37. Drapkin R, Reardon JT, Ansari A, Huang JC, Zawel L, et al. 1994. Dual role of TFIIH in DNA excision repair and in tran­scription by RNA polymerase II. Nature 368:769-72

38. Eisen A, Lucchesi JC. 1998. Unraveling the role ofhelicases in transcription. BioEs-says 20:634-41

39. Eisen JA,Hanawalt PC. 1999. Aphyloge-nomic study of DNA repair genes, proteins, and processes. Mutat. Res. 435:171-213

40. Eisen JA, Sweder KS, Hanawalt PC. 1995. Evolution of the SNF2 family of proteins:subfamilies with distinct sequences and functions. Nucleic Acids Res. 23:2715-23

41. Ellis NA, Ciocci S, Proytcheva M, Lennon D, Groden J, German J. 1998. The Ashke-nazic Jewish Bloom syndrome mutation bim^ is present in non-Jewish Americans of Spanish ancestry. Am. J. Hum. Genet. 63:1685-93

42. Ellis NA, German J. 1996. Molecular ge­netics of Bloom's syndrome. Hum. Mol. Genet. 5:1457-63

43. Ellis NA, Groden J, Ye TZ, Straughen J, Lennon DJ, et al. 1995. The Bloom's syndrome gene product is homologous to RecQ helicases. Cell 83:655-66

44. Ellis NA, Proytcheva M, Sanz MM, Ye TZ, German J. 1999. TransfectionofBLMinto cultured bloom syndrome cells reduces the sister-chromatid exchange rate toward nor­mal. Am. J. Hum. Genet. 65:1368-74

45. Epstein CJ, Martin GM, Schultz AL, Mo-tulsky AG. 1966. Wemer's syndrome: a review of its symptomatology, natural his­tory, pathologic features, genetics and re­lationship to the natural aging process. Medicine 45:177-221

46. Evans E, Moggs JG, Hwang JR, Egly JM, WoodRD. 1997. Mechanism of open com­plex and dual incision formation by human nucleotide excision repair factors. EMBO J. 16:6559-73

47. Fass D, Bogden CE, Berger JM. 1999. Crystal structure of the N-terminal domain of the DnaB hexameric helicase. Struct. Fold. Des. 7:691-98

48. Feaver WJ, Henry NL, Wang Z, Wu X, Svejstmp JQ, et al. 1997. Genes for Tfb2, Tfb3, and Tfb4 subunits of yeast tran­scription/repair factor IIH: homology to human cyclin-dependent kinase activat­ing kinase and IIH subunits. J. Biol. Chem. 272:19319-27

49. Feaver WJ, Huang W, Friedberg EC. 1999. The TFB4 subunit of yeast TFIIH is required for both nucleotide excision repair and RNA polymerase n transcrip­tion. J. Biol. Chem. 274:29564-67

50. Feaver WJ, Svejstmp JQ, Bardwell L, Bardwell AJ, Buratowski S, et al. 1993. Dual roles ofamultiprotein complex from S. cerevisiae in transcription and DNA re­pair. Cell 75:1379-87

51. Flores O, Lu H, Reinberg D. 1992. Fac­tors involved in specific transcription by mammalian RNA polymerase II. Identifi­cation and characterization of factor IIH. J. Biol. Chem. 267:2786-93

52. Foucault F, Vaury C, Barakat A, Thibout D, Planchon P, et al. 1997. Characteriza­tion of a new BLM mutation associated with a topoisomerase n alpha defect in a patient with Bloom's syndrome. Hum. Mol. Genet. 6:1427-34

53. Friedberg EC, Meira LB, Cheo DL. 1998. Database of mouse strains carrying tar­geted mutations in genes affecting cellu­lar responses to DNA damage. Mutat. Res. 407:217-26

54. Fry M, Loeb LA. 1998. The three faces of the WS helicase. Nat. Genet. 19:308-9

55. Fry M, Loeb LA. 1999. Human Wemer syndrome DNA helicase unwinds tetrahe-dral stmctures of the fragile X syndrome repeat sequence d(CGG)n. J. Biol. Chem. 274:12797-802

56. Fujiwara Y, Higashikawa T, Tatsumi M. 1977. A retarded rate of DNA replica­tion and normal level of DNA repair in Wemer's syndrome fibroblasts in culture. J.CellPhysiol. 92:365-74

 57a. Fukuchi K, Martin GM, Monnat RJ Jr. 1989. Mutator phenotype of Wemer syndrome is characterized by extensive deletions. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:5893-97

57b. Fukuchi K, Tanaka K, Kumahara Y, Marumo K, Pride MB, et al. 1990. Increased frequency of 6-thioguanine-resistant peripheral blood lymphocytes in Wemer syndrome patients. Hum. Genet. 84:249-52

58. Gangloff S, McDonald JP, Bendixen C, Arthur L, Rothstein R. 1994. The yeast type I topoisomerase Top3 interacts with Sgsl, a DNA helicase homolog: a poten­tial eukaryotic reverse gyrase. Mol. Cell. Biol. 14:8391-98

59. Gerard M, Fischer L, Moncollin V, Chipoulet JM, Chambon P, Egly JM. 1991. Purification and interaction proper­ties of the human RNA polymerase B(II) general transcription factor BTF2. J. Biol. Chem. 266:20940-45

60. German J, Bloom D, Passarge E, Fried K, Goodman RM, et al. 1977. Bloom's syn­drome. VI. The disorder in Israel and an estimation of the gene frequency in the Ashkenazim. Am. J. Hum. Genet. 29: 553-62

61. German J, Ellis NA. 1998. Bloom syn­drome. In The Genetic Basis of Human Cancer, ed. B Vogelstein, KW Kinzler, 15:301-15. New York: McGraw-Hill. 731 pp.

62. Gharibyan V Youssoufian H. 1999. Lo­calization of the Bloom syndrome heli­case to punctate nuclear structures and the nuclear matrix and regulation during the cell cycle: comparison with the Wemer's syndrome helicase. Mol. Carcinog. 26: 261-73

63. Gorbalenya AE, Koonin EV, Donchenko AP, Blinov VM. 1989. Two related su-perfamilies of putative helicases involved in replication, recombination, repair and expression of DNA and RNA genomes. Nucleic Acids Res. 17:4713-20

64. Gostissa M, Hengstermann A, Fogal V, Sandy P, Schwarz SE, et al. 1999. Ac­tivation of p53 by conjugation to the ubiquitin-like protein SUMO-1. EMBO J. 18:6462-71

65. Goto M, Imamura 0, Kuromitsu J, Mat-sumoto T, Yamabe Y, et al. 1997. Analy­sis of helicase gene mutations in Japanese Wemer's syndrome patients. Hum. Genet. 99:191-93

66. Goto M, Rubenstein M, Weber J, Woods K, Drayna D. 1992. Genetic linkage of Wemer's syndrome to five markers on chromosome 8. Nature 355:735-38

67. Gray MD, Shen J-C, Kamath-Loeb AS, Blank A, Sopher BL, et al. 1997. The Wemer syndrome protein is a DNA heli­case. Ato Genet. 17:100-3

68. Gray MD, Wang L, Youssoufian H, Mar­tin GM, Oshima J. 1998. Wemer helicase is localized to transcriptionally active nu-cleoli of cycling cells. Exp. Cell Res. 242: 487-94

68a. Gross CH, Shuman S. 1995. Muta-tional analysis of vaccinia vims nucle-oside triphosphate phosphohydrolase II, a DexH box RNA helicase. J. Virol. 69:4727-36

68b. Gross CH, Shuman S. 1996. The QRx-GRxGRxxxG motif of the vaccina vims DexH box RNA helicase NPH-II is re­quired for ATP hydrolysis and RNA un­winding but not for RNA binding. J. Virol. 70:1706-13

69. Guzder SN, Habraken Y, Sung P, Prakash L, Prakash S. 1995. Reconstitution of yeast nucleotide excision-repair with pu­rified Rad proteins, replication protein-A, and transcription fator TFIIH. J. Biol. Chem. 270:12973-76

70. Hanada K, Ukita T, Kohno Y, Saito K, Kato J-I, Ikeda H. 1997.   RecQ DNA helicase is a suppressor of ille­gitimate recombination in Escherichia coli. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94:3860-65

71. Hanaoka F, Takeuchi F, Matsumura T, Goto M, Miyamoto T, Yamada M. 1983. Decrease in the average size of repli-cons in a Wemer syndrome cell line by Simian vims 40 infection. Exp. Cell Res. 144:463-67

72. Harmon FG, DiGate RJ, Kowalczykovski SC. 1999. RecQ helicase and topoiso-merase III comprise a novel DNA strand passage function: a conserved mechanism for control of DNA recombination. Mol. Cell. 3:611-20

73. Harmon FG, Kowalczykovski SC. 1998. RecQ helicase, in concert with RecA and SSB proteins, initiates and dismpts DNA recombination. Genes Dev. 12:1134-44

74. He Z, Henricksen LA, Wold MS, Ingles CJ. 1995. RPA involvement in the damage-recognition and incision steps ofnucleotide excision repair. Nature 374:566-69

75. Henning KA, Peterson C, Legerski R, Friedberg EC. 1994.    Cloning the Drosophila homolog of the xeroderma pig-mentosum complementation group C gene reveals homology between the predicted human and Drosophila polypeptides and that encoded by the yeast RAD4 gene. Nucleic Acids Res. 22:257-61

76. Heo SJ, Tatebayashi K, Ohsugi I, Shi-mamoto A, Fumichi Y, Ikeda H. 1999. Bloom's syndrome gene suppresses pre­mature ageing caused by Sgsl deficiency in yeast. Genes Cells 4:619-25

77. Huang S, Li B, Gray M, Oshima J, Mian IS, Campisi J. 1998. The premature age­ing syndrome protein, WRN, is a 3^/ —> 5^/ exonuclease. Nat. Genet. 20:114-16

78. Hwang BJ, Ford JM, Hanawalt PC, Chu G. 1999. Expression of the p48 xeroderma pigmentosum gene is p53-dependent and is involved in global genomic repair. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96:424-28

79. Hwang JR, Moncollin V, Vermeulen W, Seroz T, van Vuuren H, et al. 1996. A 3' ->5' XPB helicase defect in re­pair/transcription factor TFIIH of xero­derma pigmentosum group B affects both DNA repair and transcription. J. Biol. Chem. 271:15898-904

80. Imamura 0, Ichikawa K, Yamabe Y, Goto M, Sugawara M, et al. 1997. Cloning of a mouse homologue of the human Wemer syndrome gene and assignment of 8A4 by fluorescence in situ hybridization. Genomics 41:298-300

81. Johnson FB, Lombard DB, Neff N, Mas-trangelo MA, Dewolf W, et al. 2000. As­sociation of the Bloom syndrome protein with topoisomerase III in somatic and mei-otic cells. Cancer Res. 60:1162-67

82. Kamath-Loeb AS, Shen JC, Loeb LA, Fry M. 1998. Wemer syndrome pro­tein. II. Characterization of the integral 3^/ -> 5^/ DNA exonuclease. J. Biol. Chem. 273:34145-50

83. Kaneko H, Koji 00, Matsui E, Shimozawa N,FukaoT,etal. 1997. BLM (the causative gene of Bloom syndrome) protein translo-cation into the nucleus by a nuclear local­ization signal. BBRC 240:348-53

84. Karow JK, Chakraverty RK, Hickson ID. 1997. The Bloom's syndrome gene prod­uct is a 3^/-5^/ DNA helicase. J. Biol. Chem. 272:30611-14

85. Karow JK, Newman RH, Freemont PS, Hickson ID. 1999. Oligomeric ring struc­ture of the Bloom's syndrome helicase. Curr. Biol. 9:597-600

86. Keeney S, Eker AP, Brody T, Vermeulen W, Bootsma D, et al. 1994. Correction of the DNA repair defect in xeroderma pig­mentosum group E by injection of a DNA damage-binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:4053-56

87. Kim JL, Morgenstem KA, Griffith JP, Dwyer MD, Thomson JA, et al. 1998. Hep­atitis C virus NS3 RNA helicase domain with a bound oligonucleotide: the crystal stmcture provides insights into the mode of unwinding. Structure 6:89-100

88. Kim S,DallmannHG,McHenryCS, Mar­ians KJ. 1996. Coupling of a replicative polymerase and helicase: a tau-DnaB in­teraction mediates rapid replication fork movement. Cell 84:643-50

89. Kitao S, Lindor NM, Shiratori M, Fu­michi Y, Shimamoto A. 1999. Rothmund-Thomson syndrome responsible gene, RECQL4: genomic structure and products. Genomics 61:268-76

90. Kitao S, Ohsugi I, Ichikawa K, Goto M, Fu-michi Y, et al. 1998. Cloning of two new human helicase genes of the RecQ family: biological significance of multiple species in higher eukaryotes. Genomics 54:443-52

91. Kitao S, Shimamoto A, Goto M, Miller RW, Smithson WA, et al. 1999. Muta­tions in RecQ4 helicase cause a subset of cases of Rothmund-Thomson syndrome. Nat. Genet. 22:82-84

92. Korolev S, Hsieh J, Gauss GH, Lohman T, Waksman G. 1997. Major domain swivel-ing revealed by the crystal stmctures of complexes of E. coli Rep helicase bound to single-stranded DNA and ADP. Cell 90:635-47

93. Kusano K, Berres ME, Engels WR. 1999. Evolution of the RECQ family ofhelicases:

A drosophila homolog, Dmbim, is similar to the human bloom syndrome gene. Ge­netics 151:1027-39

94. Kyoizumi S, Kusunoki Y, Seyama T, Hata-mochi A, Goto M. 1998. In vivo somatic mutations in Wemer's syndrome. Hum. Genet. 103:405-10

95. LebelM.LederP. 1998. A deletion within the murine Wemer syndrome helicase in­duces sensitivity to inhibitors of topoi-somerase and loss of cellular prolifera-tive capacity. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:13097-102

96. Lebel M, Spillare EA, Harris CC, Leder R 1999. The Wemer syndrome gene product co-purifies with the DNA replication com­plex and interacts with PCNA and topoiso-merase I. J. Biol. Chem. 274:37795-99

97. Lee SK, Johnson RE, Yu SL, Prakash L, Prakash S. 1999. Requirement of yeast SGS1 and SRS2 genes for replication and transcription. Science 286:2339-42

98. Lehmann AR. 1995. Nucleotide exci­sion repair and the link with transcription. Trends Biochem. Sci. 20:402-5

99. LeRoy G, Drapkin R, Weis L, Reinberg D. 1998. Immunoaffinity purification of the human multisubunit transcription factor IIH. J. Biol. Chem. 273:7134-40

100. Li L, Elledge SJ, Peterson CA, Bales ES, Legerski RJ. 1994. Specific association between the human DNA repair proteins XPA and ERCC1. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:5012-16

101a. Li L, Eng C, Desnick RJ, German J, Ellis NA. 1998. Carrier frequency of the Bloom syndrome bim^ mutation in the Ashkenazi Jewish population. Mol. Genet. Metab. 64:286-90
101b. Lindahl T, Wood RT. 1999. Quality control by DNA repair. Science 286: 1897-905

102. Lindor NM, Devries EM, Michels VV, Schad CR, Jalal SM, et al. 1996. Rothmund-Thomson syndrome in sib­lings: evidence for acquired in vivo mo-saicism. Clin. Genet. 49:124-29

103. Liu Z, Macias MJ, Bottomley MJ, Stier G, Linge JP, et al. 1999. The three-dimensional stmcture of the HRDC do­main and implications for the Wemer and Bloom syndrome proteins. Struct. Fold. Des. 7-.1557-66

104. Lohman TM,BjomsonKP. 1996. Mech­anisms of helicase-catalyzed DNA un­winding. Annu. Rev. Biochem. 65:169-214

105. Lombard DB, Guarente L. 1996. Cloning the gene for Wemer syndrome: a disease with many symptoms of pre­mature aging. Trends Genet. 12:283-86

106. Deleted in proof

107. LuJ, MullenJR, Brill SJ, KleffS, Romeo AM, et al. 1996. Human homologues of yeast helicase. Nature 383:678-79.

108. Ma L, Siemssen ED, Notebom HM, van der Eb AJ. 1994. The xeroderma pig-mentosum group B protein ERCC3 pro­duced in the baculovirus system exhibits DNA helicase activity. Nucleic Acids Res. 22:4095-102

109. Mahajan R, Delphin C, Guan T, Gerace L, Melchior R 1997. A small ubiquitin-related polypeptide involved in targeting RanGAPl to nuclear pore complex pro­tein RanBP2. Cell 88:97-107

110. Mahajan R, Gerace L, Melchior R 1998. Molecular characterization of the SUMO-1 modification of RanGAPl and its role in nuclear envelope association. J. Cell. Biol. 140:259-70

111. Marciniak RA, Lombard DB, Johnson FB, Guarente L. 1998. Nucleolar local­ization of the Wemer syndrome protein in human cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:6887-92

112. Masutani C, Sugasawa K, Yanagisawa J, Sonoyama T, Ui M, et al. 1994. Purifica­tion and cloning of a nucleotide excision repair complex involving the xeroderma pigmentosum group C protein and a hu­man homologue of yeast RAD23. EMBO J. 13:1831-43

113. Matson SW, Bean DW, George JW. 1993. DNA helicases: enzymes with essential roles in all aspects of DNA metabolism. BioEssays 16:13-22

114. Matsumoto T, Shimamoto A, Goto M, Fumichi Y. 1997. Impaired nuclear lo­calization of defective DNA helicases in Werner's syndrome. Nat. Genet. 16:335-36

115. Matsumoto T, Imamura 0, Yamabe Y, Kuromitsu J, Tokutake Y, et al. 1997. Mutation and haplotype analyses of the Wemer's syndrome gene based on its ge-nomic stmcture: genetic epidemiology in the Japanese population. Hum. Genet. 100:123-30

116. Matunis MJ, Wu J, Blobel G. 1998. SUMO-1 modification and its role in tar­geting the Ran GTPase-activating protein, RanGAPl, to the nuclear pore complex. J. Cell. Biol. 140:499-509

117. McDaniel LD, Chester N, Watson M, Okamoto N, Sills BB, et al. 1999. A mouse model for compound heterozygos-ity at the Bloom syndrome locus. Am. J. Hum. Genet. 65(Suppl.):A49

118. Moreland RJ, Tirode F, Yan Q, Conaway JW, Egly JM, Conaway RC. 1999. A role for the TFIIH XPB DNA helicase in pro­moter escape by RNA polymerase II. J. Biol. Chem. 274:22127-30

119. Moser MJ, Oshima J, Monnat RJ Jr. 1999. WRN mutations in Wemer syn­drome. Hum. Mutat. 13:271-79

120. Mounkes LC, Jones RS, Liang BC, Gel-bart W, Fuller MT. 1992. A Drosophila model for xeroderma pigmentosum and Cockayne's syndrome: haywire encodes the fly homolog ofERCC3, a human ex­cision repair gene. Cell 71:925-37

121. Mu D, Hsu DS, Sancar A. 1996. Re­action mechanism of human DNA re­pair excision nuclease. J. Biol. Chem. 271:8285-94

122. Mu D, Sancar A. 1997. Model for XPC-independent transcription-coupled repair of pyrimidine dimers in humans. J. Biol. Chem. 272:7570-73

123a. Mueller J, Smerdon M. 1996. Rad23 is required for transcription-coupled re­pair and efficient overall repair in Sac-charomyces cerevisiae. Mol. Cell. Biol. 16:2361-68

123b. Murray JM, Lindsay HD, Munday CA, Carr AM. 1997. Role of Schizosac-charomyces pombe RecQ homolog, re­combination, and checkpoint genes in UV damage tolerance. Mol. Cell. Biol. 17:6868-75

124. Mushegian AR, Bassett DE Jr, Boguski MS, Bork P, Koonin EV. 1997. Position-ally cloned human disease genes: pat­terns of evolutionary conservation and functional motifs. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94:5831-36

125. Nakayama H, Nakayama K, Nakayama R, Irino N, Nakayama Y, et al. 1984. Isolation and genetic characterization of a thymineless death-resistant mutant of Escherichia coli K12: identification of a new mutation (recQl) that blocks the RecF recombination pathway. Mol. Gen. Genet. 195:474-80

126. Neff NF, Ellis NA, Ye T-Z, Noonan J, Huang K, et al. 1999. The DNA helicase activity of BLM is necessary for the correction of the genomic instability of Bloom syndrome cells. Mol. Biol. Cell 10:665-76

127. Nichols AF, Ong P, Linn S. 1996. Muta­tions specific to the xeroderma pigmen-tosum group E Ddb-phenotype. /. Biol. Chem. 271:24317-20

128. Oddoux C, Clayton CM, Nelson HR, Os-trer H. 1999. Prevalence of Bloom syn­drome heterozygotes among Ashkenzi Jews. Am. J. Hum. Genet. 64:1241-43

129. Ogbum CE, Oshima J, Poot M, Chen R, Hunt KE, et al. 1997. An apoptosis-inducing genotoxin differentiates het-erozygotic carriers for Wemer helicase mutations from wild-type and homozy-gous mutants. Hum. Genet. 101:121-25

130. Okura T, Gong L, Kamitani T, Wada T, Okura I, et al. 1996. Protection against Fas/APO-1- and tumor necrosis factor-mediated cell death by a novel protein, sentrin. J. Immunol. 157:4277-81

131. Orren DK, Brosh RM Jr, Nehlin JO, Machwe A, Gray MD, Bohr VA. 1999. Enzymatic and DNA binding properties of purified WRN protein: high affinity binding to single-stranded DNA but not to DNA damage induced 4NQO. Nucleic Acids Res. 27:3557-66

132. Orren DK, Sancar A. 1989. The (A)BC excinuclease of Escherichia coli has only the UvrB and UvrC subunits in the inci­sion complex. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:5237-41

133. Oshima J, Yu CE, Piussan C, Klein G, Jabkowski J, et al. 1996. Homozygous and compound heterozygous mutations at the Wemer syndrome locus. Hum. Mol. Genet. 5:1909-13

134. Park CH, Mu D, Reardon JT, Sancar A. 1995. The general transcription-repair factor TFIIH is recmited to the excision repair complex by the XPA protein inde­pendent of the TFIIE transcription factor. J. Biol. Chem. 270:4896-902

135. Poot M, Gollahon KA, Rabinovitch PS. 1999. Wemer syndrome lymphoblas-toid cells are sensitive to camptothecin-induced apoptosis in S-phase. Hum. Genet. 104:10-14

136. Prince PR, Ogbum CE, Moser MJ, Emond MJ, Martin GM, et al. 1999. Cell fusion corrects the 4-nitroquinoline 1-oxide sensitivity of Wemer syndrome fibroblast cell lines. Hum. Genet. 105:132-38

137. Puranam KL, Blackshear PJ. 1994. Cloning and characterization of RECQL, a potential human homologue of the Es­cherichia coli DNA helicase RecQ. 7. Biol. Chem. 269:29838-45

138. Reynaud E, Lomeli H, Vazquez M, Zurita M. 1999. The Drosophila melanogaster homologue of the xeroderma pigmento-sum D gene product is located in euchro-matic regions and has a dynamic response to UV light-induced lesions in polytene chromosomes. Mol. Biol. Cell 10:1191-203

139. Riou L, Zeng L, Chevallier-Lagente 0, Stary A, Nikaido 0. 1999. The relative expression of mutated XPB genes results in xeroderma pigmentosum/Cockayne's syndrome or trichothiodystrophy cellular phenotypes. Hum. Mol. Genet. 8:1125-33

140. Roa BB, Savino CV, Richards CS. 1999. Ashkenazi Jewish population frequency of the Bloom syndrome gene 2281 delta 6ins7 mutation. Genet. Test. 3:219-21

141. Robles Al, Wang XW, Harris CC. 1999. Drug-induced apoptosis is delayed and re­duced in XPD lymphoblastoid cell lines:

possible role of TFIIH in p53-mediated apoptotic cell death. Oncogene 18:4681-88

142. Rodriguez MS, Desterro JM, Lain S, Midgley CA, Lane DP, et al. 1999. SUMO-1 modification activates the tran-scriptional response of p53. EMBO J. 18:6455-61

143. Runyon GT, Bear DG, Lohman TM. 1990. Escherichia coli helicase II (UvrD) protein initiates DNA unwinding at nicks and blunt ends. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:6383-87

144. SandbergAA.ed. 1982. Sister Chromatid Exchange. New York: Liss. 706 pp.

145. Sato K, Goto M, Nishioka K, Arima K, Hori N, et al. 1988. Wemer's syndrome associated with malignancies: five case reports with a survey of case histories in Japan. Gerontology 34:212-18

146. Sawaya MR, Guo S, Tabor S, Richardson CC, Ellenberger T. 1999. Crystal struc­ture of the helicase domain from the replicative helicase-primase of bacterio-phageT7. Cell 99:167-77

147. Schaeffer L, Moncollin V, Roy R, Staub A, Mezzina M, et al. 1994. The ERCC2/DNA repair protein is associated with the class II BTF2/TFIIH transcrip­tion factor. EMBO J. 13:2388-92

148. Schaeffer L, Roy R, Humbert S, Mon­collin V, Vermeulen W, et al. 1993. DNA repair helicase: a component of BTF2 (TFIIH) basic transcription factor. Sci­ence 260:58-63

149. Schultz RA, McDaniel LD, Luo G, Bradley A. 1998. Development of a mouse model for Bloom syndrome. Am. J. Hum. Genet. 63(Suppl.):A206

150. Sekelsky JJ, Brodsky MH, Rubin GM, Hawley RS. 1999. Drosophila and human RecQ5 exist in different isoforms gener­ated by alternative splicing. Nucleic Acids Res. 27:3762-69

151. Sekelsky JJ.McKimKS, Chin GM, Haw-ley RS. 1995. The Drosophila meiotic re­combination gene mei9 encodes a homo-logue of the yeast excision repair protein Radl. Genetics 141:619-27

152. Seki M, Enomoto T, Yanagisawa J, Hanaoka F, Ui M. 1988. Further char­acterization of DNA helicase activity of mouse DNA-dependent adenosinet-riphosphate B (DNA helicase B). Bio­chemistry 27:1766-71

153. Seki M, Miyazawa H, Tada S, Yanagi­sawa J, Yamaoka T, et al. 1994. Molecular cloning of cDNA encoding human DNA helicase Ql which has homology to Es-cherichia coli Rec Q helicase and local­ization of the gene at chromosome 12pl2. Nucleic Acids Res. 22:4566-73

154. Seki M, Yanagisawa J, Kohda T, Sonomaya T, Ui M, et al. 1994. Purifica­tion of two DNA-dependent adenosinet-riphospatases having DNA helicase activity from HeLa cells and comparison of the properties of the two enzymes. J. Biochem. (Tokyo) 115:523-31

155. Seki T, Tada S, Katada T, Enomoto T. 1997. Cloning of a cDNA encoding a novel importin-alpha homologue, Qipl: discrimination of Qipl and Rchi from hSrp! by their ability to interact with DNA helicase Ql/RecQL. BBRC 234:48-53

156. Seki T, Wang WS, Okumura N, Seki N, Katada T, Enomoto T. 1998. cDNA cloning of mouse BLM gene, the homo­logue to human Bloom's syndrome gene, which is highly expressed in the testis at the mRNA level. Biochim. Biophys. Acta 1398:377-81

157. Sen D, Gilbert W. 1988. Formation of parallel four-stranded complexes by guanine-rich motifs in DNA and its impli­cations for meiosis. Nature 334:364—66

158. Shahrabani-Gargir L, Shomrat R, Yaron Y, Orr-Urtreger A, Groden J, Legum C. 1998. High frequency of a common Bloom syndrome Ashkenazi mutation among Jews of Polish origin. Genet. Test. 2:293-96

159. Shen JC, Gray MD, Oshima J, Kamath-Loeb AS, Fry M, Loeb LA. 1998. Werner syndrome protein. I. DNA heli­case and dna exonuclease reside on the same polypeptide. J. Biol. Chem. 273:34139-44

160. Shen JC, Gray MD, Oshima J, Loeb LA. 1998. Characterization of Werner syndrome protein DNA helicase activity: directionality, substrate dependence and stimulation by replication protein A. Nu­cleic Acids Res. 26:2879-85